Собственно сам WebTunnel не нужен (но не помешает конечно), скрипт (без WebTunnel) будет состоять из строк
#!/bin/sh
cp /home/amnesia/Persistent/webtunnel_start/torrc /etc/tor/torrc
systemctl restart tor
Закрывать TCA, для подключения к tor запускать скрипт.